Actualmente los frailes de San Esteban oran comunitariamente en la capilla de Sotomayor. Pero antiguamente, cuando formaban una comunidad muy numerosa, lo hacían en el coro de la iglesia.
Este coro se halla asentado sobre un arco escarzano atrevidísimo, rematado por una pesada balaustrada de piedra.
La sillería, obra de Alonso de Balbás (concluida en 1655), es de estilo clasicista.
En la crestería y en las misericordias, que son las partes más decoradas, trabajo el tallista Juan de Mondravilla.
A él se debe también el enorme facistol o atril que hay en medio del coro, pieza fantástica, no solo por sus dimensiones, sino también por la ejecución de la talla.
En él se conserva la pintura del Triunfo de la Iglesia de Antonio Palomino.